Shared Flashcard Set

Details

Microbiologie I
N/A
124
Microbiology
Undergraduate 1
12/08/2012

Additional Microbiology Flashcards

 


 

Cards

Term
Bdellovibrio
Definition
Une prédateur microbienne qui perce un trou dans la paroi cellulaire et s'insinue dans l'espace périplasmique. Interêt pour l'usage comme probiotique
Term
Vampirococcus
Definition
Prédateur microbienne qui s'attache en épibiote à la membrane externe de sa proie et sécrète des enzymes de dégradation qui libèrent le cytoplasme du proie
Term
Daptobacter
Definition
Prédateur microbienne qui pénètre dans la cellule proie et se nourrit directement du contenu cytoplasmique
Term
Effets bénéfiques de la prédation?
Definition
- peut conduire à l'augmentation des vitesses de recyclage des éléments nutritifs
- peut fournir un environnement protecteur, riche en nourriture pour une proie particulière
Term
Parasitisme
Definition
Une relation entre deux organismes où l'un des deux tire profit de l'autre, et où l'hôte est habituellement lésé
Term
Dans le parasitisme, pourquoi une relation équilibre hôte-parasite est-elle importante?
Definition
- Si l'équilibre favorise l'hôte, le parasite perd son habitat et mourrit
- Si l'équilibre favorise le parasite, il se peut que l'hôte tombe malade et meure.
Term
Donne un exemple microbien d'un parasite qui touche aux humains
Definition
Rickettsia typhi, qui est véhiculée par les puces qui vivent sur les rats. Peut donner le typhus si les humains entrent en contact avec les rats
Term
Décrire les lichens
Definition
Une association entre des ascomycètes (champignon) et certains genres d'algues verts ou cyanobactéries.
- partenaire fongique et le mycobiote
- l'algue est le phycobiote (fait la photosynthèse)
=parasitisme du à la nature invasive que le champignon prend son NRG directement de l'algue
Term
Réduction génomique
Definition
une fois la parasite est établie avec son hôte, ly symbiote tendra à éliminer son information génomique non utilisée.
Ex: bucherna aphidocola, mycobacterium leprae
Term
Amensalisme
Definition
Il s'agit d'un composé spécifique qui a un effet négatif sur un autre organisme.
Ex: antibiotiques
Term
Donne un exemple d'amensalisme
Definition
Fourmis qui tire profit d'une relation amensale entre un actinomycète pour contrôler les champignons parasites dans leur jardin fongique
- le parasite: Escovopsis
- l'espèce voulu: Leucoprini
- l'organisme 'antibiotique': Pseudonocardia
Term
Fonction de la Nisine
Definition
Bactériocine amensalisme qui empêche le développement de pathogènes dans les produits laitiers
Term
Compétition
Definition
lorsque différents m.orgs d'une population ou d'une communauté cherchent à s'approprier une même ressource, qu'il s'agisse d'occuper un endroit physique ou de consommer un aliment limitant particulier
Term
Principe de l'exclusion compétitive
Definition
Si un des deux organismes en compétition peut dominer le milieu, l'autre serai exclue.
Term
Bactériocines
Definition
composés organiques spécifiques qui provoquent des ruptures dans la paroi cellulaire ou la membrane cytoplasmique des m.orgs cibles
Term
Pathogénicité
Definition
La capacité de produire des modifications pathologiques, c-à-d une maladie.
Term
Pathogène
Definition
Un micro organisme qui provoque une maladie
Term
Animaux axénique
Definition
Sans micro organismes (sans germe/pas de flore). Utile pour la recherche sur les interactions des animaux et de leurs m. orgs.
Term
Animaux gnotobiotique
Definition
Animaux dont toute la microflore est connue OU un animal contrôlé microbiologiquement
Term
Quels avantages ont les bébés nourris au sein?
Definition
La flore interne vient de ce qu'on mange. Le lait humain agit comme milieu séléctif pour les bacréries non pathogènes. On voit 90% des bacs intestinales sont les bifidobactéries (bénéfices)
Term
Décrire deux types de m.orgs commensaux sur la peau
Definition
- Organismes résidants qui se développent normalement sur ou dans la peau
- Transitoires: présents temporairement. (généralement incapables de se multiplier)
Term
Kératinocytes
Definition
épaisses cellules étroitement serrées qui constituent la couche externe de la peau
Term
Cathélicidines
Definition
Peptides antimicrobiens produits par les glandes sudiopares qui aident à la protection contre les agents infectieux en formant des pores dans les membranes cytoplasmiques bactériennes
Term
Quel antibiotique aidera à la traitement d'acné?
Definition
tétracycline
Term
Facteurs intrinsèques
Definition
facteurs liés à laliment lui-même, comme le pH, l'humidité, disponibilité de l'eau
Term
Facteurs extrinsèques
Definition
Facteurs liés à l'environnement où l'aliment est stocké, comme température, humidité relative, les gaz (CO2, H2O)
Term
Un aliment d'hydrates de carbone favorise la croissance de quel m.org?
Definition
Champignons (sur le pains, confitures, etc)
Term
Un aliment contenant de grandes quantités de protéines et/ou graisses (viande, beurre) favorise quelle croissance microbienne?
Definition
Bactéries, qui les donne une odeur
Term
Donner une manière d'éliminer les m.orgs de la bière ou vin
Definition
La filtration
Term
Dogme central
Definition
La voie qui mène de l'ADN à l'ARN et de l'ARN aux protéines
Term
ARN polymérases catalyse quoi?
Definition
La transcription
Term
Décrit la traduction
Definition
Un ARNm est décodée et régit la synthèse d'un polypeptide. Les trois types d'ARN sont impliqués dans la production des protéines.
Term
Quels liaisons lient les chaînes phosphate-sucre-base?
Definition
Liaisons phosphodiester
Term
Décrit l'hélice d'ADN
Definition
10 paires de bases par tour d'hélice, tournent dans le sens antihorlogique, grand sillon et petit sillon (asymétrique)
Term
Histones
Definition
Sont de petites protéines basiques, riches en lysine et arginine. Cing types: H1 H2A H2B H3 H4. 8 molécules forment un ellipsoïde. Combinaison d'ADN et histones forment un nucléosome.
Term
Où commence la réplication des chromosomes circulaires?
Definition
L'origine
Term
Décrit la réplication d'un chromosome circulaire
Definition
- Commence à l'origine
- Deux fourches de réplication se déplacent à partir de l'origine jusqu'à ce qu'elles aient copié tout le réplicon
Term
La synthèse de l'ADN est catalysée par quels enzymes?
Definition
ADN polymérases
Term
Amorce
Definition
où la synthèse d'ADN commence. Fournit un groupe 3'-hydroxyle libre
Term
Enzymes noyaux
Definition
responsable de la catalyse de la synthèse de l'ADN et son autocorrection (Ex: ADN polymérase III)
Term
Hélicases
Definition
Responsable de la séparation des brins d'ADN
Term
Les protéines SSB
Definition
maintiennent les brins ADN éloignés l'un de l'autres quant ils ont été séparés
Term
topoisomérases: rôle et un exemple
Definition
soulagent la tension induite par le déroulement rapide de la double hélice d'ADN
Ex: ADN gyrase
Term
Dans quel direction est-ce que les ADN polymérases synthétisent d'ADN?
Definition
5'-3'
Term
Brin avancé
Definition
le brin complémentaire d'ADN qui peut être synthétisé de façon continue à son extrémité 3' (5'->3')
Term
Brin retardé
Definition
Brin qui ne peut être synthétisé de façon continue parce qu'il n'y a pas de 3'-OH libre. Elle est synthétisé en fragments Okazaki. Ce brin requiert plusieurs amorces
Term
Les deux brins d'ADN sont liés par quoi?
Definition
ADN polymérase III (centromère)
Term
Primase
Definition
synthèse un court brin d'ADN qui servira comme amorce
Term
Locus oriC
Definition
origine de la réplication du chromosome
Term
Caténane
Definition
Chromosome circulaire filles entrelacés après la réplication. Achèvement par les topoisomérases
Term
Télomérase
Definition
Assure que la longueur du chromosome d'ADN est maintenue pour les chromosomes linéaires. Deux composants: une protéine qui peut synthétiser de l'ADN en utilisant une matrice d'ARN (transcriptase inverse télomérase) et une matrice ARN interne
Term
Gène
Definition
Une séquence linéaire de nucléotides avec un point de départ et un point de terminaison précis
Term
Extrons
Definition
séquence des gènes eucaryotes qui peuvent être codées. Sont interrompus par des séquences non-codants (introns)
Term
Introns
Definition
séquence de gènes non-codants des eucaryotes
Term
ARNm
Definition
ARN produit par un gène qui code pour une protéine
Term
Promoteur
Definition
situé au début du gène. Un site de reconnaissance et de liaison pour l'ARN polymérase. N'est ni transcrit, ni traduit.
Term
ARN polymérase
Definition
L'enzyme qui synthétise l'ARN
Term
Codon stop
Definition
signale la fin de la protéine et arrête la traduction par le ribosome. Au cours de la transcription sa déloge l'ARN polymérase de l'ADN matrice
Term
Trois processus de la transcription
Definition
Initiation, élongation, terminaison
Term
Qu'est-ce que commence l'initiation de la transcription?
Definition
Liaison de l'ARN polymérase au promoteur du gène
Term
Que signifie TATAAT?
Definition
Région sur le promoteur bactérien; point du départ de transcription
Term
Comment diffère-t-elle la transcription chez les eucaryote de celle des procaryotes?
Definition
- 3 ARN polymérases majeurs (1 pour bacs)
- Ce ARN polymérase II a besoin de facteurs de transcription supplémentaires pour reconnaître les promoteurs
- Promoteurs eucaryotes ont la boîte TATA
- ARNm eucaryotes subit des modifications post-transcriptionnelles
- on ne trouve pas vraiment de gènes interrompus (introns/extrons) chez les procaryotes
Term
ARN polymérase II
Definition
synthèse de l'ARNm pendant la transcription
Term
ARN polymérases I et III
Definition
synthétisent respectivemetn l'ARNr et l'ARNt
Term
Épissage de l'ARN
Definition
les introns sont excisés des transcrits initiaux d'ARN (pré-ARNm)
- une séquence GU à l'extrémité 5' de l'intron et une séquence AG à son extrémité 3'
Term
Décrit la transcription chez les archées
Definition
- Une seule ARN polymérase
- Cette polymérase par contre est plus semblable au ARN polymérase II des eucaryotes
- présence de boîte TATA sur le promoteur comme les eucaryotes
- Certains gènes archéens contiennent des introns, donc besoin de traitement post-transcriptionnel
Term
Que signifie les codons UGA, UAG et UAA
Definition
ce sont des codons stop ou codons non-sens
Term
Traduction
Definition
Le décodage de l'ARNm pour former un polypeptide (protéine). Son synthèse commence par le bout N-terminal.
Term
Polyribosome ou Polysome
Definition
Une complexe d'ARN et plusieurs ribosomes. Augmente la vitesse de la synthèse d'un polypeptide (efficacité)
Term
Pourquoi les archées et les bacs peuvent encore augmenter l'efficacité de l'expression d'un gène en couplant transcription et traduction?
Definition
Ils n'ont pas de noyau, alors dès que l'ARN polymérase synthétise un ARNm, les ribosomes peuvent déjà attacher au ARNm et le traduire.
Term
Où est l'acide aminé sur l'ARNt?
Definition
Il se lie à l'acide adénylique terminal à l'extrémité 3' (séquence -C-C-A)
Term
aminoacyl-ARNt synthétases
Definition
catalyse une réaction durant laquelle les acides aminés sont activés pour la synthèse des protéines. Il en existe 20, un pour chaque a.a.. Certains d'entre eux font l'autocorrection comme les ADN polymérases
Term
Décrit les ribosomes des 3 domaines
Definition
- Procaryotes 70S
- Eucaryotes 80S
Term
Edward Jenner
Definition
Premier vaccin contre la variole
Term
Charles Chamberland
Definition
collaborer avec Louis Pasteur et inventer le premier autoclave et rendit possible la découvert des virus. Filtre en porcelaine
Term
Ivanowski
Definition
Publier des travaux avec des plantes infectées, même avoir été filtrés pour enlever les bactéries. Preuve des virus
Term
Walter Reed
Definition
Fièvre jaune
Term
Virion
Definition
Une particule virale complète formée d'une ou plusieurs molécules d'ARN ou d'ADN enfermées dans une coque protéique (capside)
Term
3 différences entre les virus et les cellules vivantes
Definition
1- organisation simple et acellulaire
2- présence de soit ADN ou ARN mais pas les deux ensembles
3- incapacité de se reproduire sans un hôte
Term
Quel microscope permet l'observation des virus?
Definition
Microscopes électroniques, soit à balayage ou à transmission
Term
Nucléocapside
Definition
Composée d'un acide nucléique (soit ADN ou ARN) et une coque protéique appelée capside
Term
Trois types de symétrie de capside chez les virus
Definition
- Hélicoïdale: arrangement en spirale
- icosaédrique: préféré par la nature.
- complexe
Term
Protomères
Definition
Forme soit des hexons out pentons dans une capside icosaédrique. Ce sont de nombreuses copies d'une ou quelques sous-unités protéiques
Term
Quel virus possède une capside icosaédrique contenant uniquement des pentamères?
Definition
Virus simien 40 (SV 40)
Term
Enveloppe virale (structure et fonction)
Definition
Provient généralement des membranes des cellules hôtes. Peuvent avoir des spicules provenant des virus mêmes. Ce sert à identifier les virus. On trouve à la facec interne une protéine non glycosylée stabilisatrice (protéine M)
Term
Neuraminidase
Definition
Projections (spicules) sur l'enveloppe des virus qui participe à la libération des virions matures
Term
Hémagglutines
Definition
Projections (spicules) sur l'enveloppe des virus qui peuvent attacher aux membranes des globules rouges et causer l'hémagglutination
Term
Lister les 4 types possibles d'acide nucléiques chez les virus
Definition
ARN simple brin, ARN double brin, ADN simple brin, ADN double brin
Term
Quel sorte de génome possède les virus des végétaux la plupart du temps?
Definition
ARN simple brin
Term
Quel sorte de génome possède les bactériophage, en général?
Definition
ADN double brin
Term
Quelle est la particularité du génome du virus phage lambda?
Definition
ADN linéaire dans la capside mais circulaire en entrant dans la cellule hôte
Term
Chaîne positive ou chaîne plus (et un exemple)
Definition
Quand la séquence des bases de certains ARNsb génomiques est identique à celle de l'ARNm viral
Ex: poliomyélite (polio)
Term
Chaîne négative ou chaîne moins (et un exemple)
Definition
Quand l'ARNsb génomique a une séquence complémentaire de celle de l'ARNm viral
Ex: rage
Term
Donnez les 5 étapes de la multiplication des virus
Definition
1- fixation du virus sur la cellule hôte
2- entrée de l'acide nucléique (génome) du virus
3- synthèse des protéines et acides nucléiques du virus
4- auto-assemblage des virions
5- libération des nouveaux virus
Term
Explique brièvement la classification des virus
Definition
Par leurs acides nucléiques, présence ou l'absence d'enveloppe, symétrie de la capside
Term
Classification phylogénétique
Definition
Comparer des organismes (classifier) sur la base de relations évolutives
Term
Classification phénétique
Definition
Groupe les organismes par la similitide de leurs caractères physiques (ce qu'on peut voir)
Term
Classification génotypique
Definition
Comparer la similarité génétique entre organismes
Term
L'hypothèse endosymbiotique
Definition
Les mitochondries et les chlorophlastes proviennent des bactéries
Term
Ribozymes
Definition
molécules d'ARN possèdent une activité catalytique
Term
Pourquoi pense-t-on que l'ARN s'est apparu en premier?
Definition
Il est capable d'effectuer du travail et de stocker l'information génétique.
Term
L'arbre phylogénétique de Carl Woese est basé sur quoi?
Definition
les séquences des ARN de la petite sous-unité ribosomique (ARNr PSU)
Term
Microévolution (anagenèse)
Definition
De petits changements génétiques aléatoires qui se produisent pendant des générations pour mener lentement soit à la spéciation, soit à l'extinction
Term
Théorie des équilibres ponctués
Definition
Le rythme de l'évolution est interrompu périodiquement par des explosions rapides de spéciation
Term
3 parties de la taxinomie
Definition
Classification: répartir les organismes dans des groupes appelés taxons
Nomenclature: donne des noms aux groupes taxinomiques
Identification: côté pratique de la taxinomie; déterminer à quel taxon appartient l'organisme
Term
Hypothèse de l'hydrogène
Definition
avec l'hypothèse endosymbiotique. C'est que l'endosymbiote était une bactérie anaérobie avec H2 et CO2 comme produits finals de fermentation. S'il a développé la capacité d'effectuer la respiration aérobie = mitochondrie. S'il n'a pas acquis cette faculté - hydrogénosome (trouvé chez certains protistes qui produisent l'ATP par fermentation)
Term
Donner les rangs taxinomiques en ordre décroissante (Tableau 19.3)
Definition
Domaine, Phylum, Classe, Ordre, Famille, Genre, Espèce
Term
Taxinomie font usage de quels caractéristiques?
Definition
- Morphologiques: (taille, forme, etc)
- Physiologiques: sources d'NRG, etc
- Écologiques: environnement
- Génétiques: séquence de gènes
Term
Quel est le méthode le plus utile pour déterminer le taxon d'une organisme?
Definition
séquençage génomique: IL peut nous donner sa famille, genre, espèce, sous-espèce et souche
Term
Pasteurisation
Definition
Chauffage des aliments à une température qui tue les micro organismes pathogènes
Term
Radiations UV
Definition
Stérilisation à la surface des aliments et l'équipement de laboratoire. Ne pénètrent pas dans la nourriture.
Term
Utilité de la réfrigération
Definition
Retarde le développement microbien
Term
[image]
Definition
Term
Cyanophycine
Definition
Composé d'une quantité égale d'Arg et Asp. Réserve d'azote pour les bactéries.
Term
Décrit brièvement la structure des ribosomes 70S
Definition
Formés de deux sous-unités, une 50S et une 30S. Chez les procaryotes (bacs et archées).
Term
Plasmides
Definition
Molécules d'ADN circulaire extrachromatique
Term
Listez quelques plasmides importantes
Definition
Conjugatifs : contenant facteur F (fertilité)
Plasmides R: résistance aux antibiotiques
Term
Décrivez la paroi d'une bactérie gram négative
Definition
Membrane cytoplasmique, espace périplasmique avec peptidoglycane (mince couche), membrance externe.
Term
Décrivez la paroi d'une cellule gram-positive
Definition
Membrane cytoplasmique, paroi cellulaire fait de peptidoglycanes (couche épaisse)
Term
Explique l'importance d'acide D-glutamique, D--alamine et l'acide méso-diaminopimélique
Definition
Empêchent une dégradation par la plupart des peptidases qui ne reconnaissent que les isomères L des acides aminés.
Term
Beaucoup des paroi bactériennes remplace l'acide méso-diaminopimélique avec quel autre acide diaminé?
Definition
L-lysine
Term
Les acides teichoïques se trouve chez les bacs gram + ou gram -?
Definition
Gram +
Term
Comment la membrane externe des gram - se lie à la cellule?
Definition
- Lipoprotéine de Braun
- sites d'adhésion
Term
Dans la coloration de Gram, le colorant cristal violet agit avec quelle partie du paroi? [?]
Definition
Acides lipotéchoïques
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